Le Secrétariat Permanent du Programme Sectoriel des Transports a pour missions de coordonner et de superviser la conception, la préparation, l’élaboration, la mise en œuvre technique, financière et le suivi-évaluation des projets de développement du secteur des transports. Le Secrétariat permanent a la responsabilité de la gestion fiduciaire et les directions des ministères la mise en œuvre technique des activités.